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经典思路不过时-南方医大:代谢组学+网药揭示甘草黄酮调控PI3KAKT信号通路抑制细胞凋亡改善胃溃疡

来源:开云网站    发布时间:2024-03-15 07:16:03

  中药甘草是植物甘草、胀果甘草和光果甘草的干燥根和根茎,最早见于《神农本草经》。甘草黄酮(LF)是从中药甘草中分离得到的主要化合物,对治疗胃溃疡(GU)有及其重要的作用。然而,要进一步探讨其根本机制。本研究旨在采用综合方法研究并进一步阐明LF对抗乙醇诱导GU的机制,在乙醇诱导的胃损伤大鼠模型中评估LF的抗GU作用;然后,应用代谢组学方法来探索特定的代谢产物和代谢途径;接下来,采用网络药理学与代谢组学相结合的策略来预测LF对GU的靶点和途径;最后,通过分子对接、实时聚合酶链式反应和蛋白质印迹验证了这些预测。LF对胃损伤有积极影响,并调节GU相关因子的表达。通过血清代谢组学分析,我们确定了LF处理GU中的25种代谢生物标志物,主要参与氨基酸代谢、碳水化合物代谢和其他相关过程;随后,构建了一个“成分-靶向代谢产物”网络,揭示了可能与GU治疗相关的六个关键靶点(HSP90AA1、AKT1、MAPK1、EGFR、ESR1、PIK3CA)。更重要的是,KEGG分析强调了包括关键靶点在内的PI3K/AKT通路的重要性,作为LF发挥抗GU作用的关键途径。分子对接分析证实,LF的关键成分对关键靶点表现出很强的亲和力。此外,实时PCR和蛋白质印迹根据结果得出,LF可以逆转这些靶点的表达,激活PI3K/AKT通路,并最终减少细胞凋亡。LF对乙醇诱导的胃溃疡具有胃保护作用,其治疗机制可能涉及通过PI3K-AKT途径改善代谢和抑制细胞凋亡。

  译名:甘草黄酮通过PI3K/AKT信号通路抑制细胞凋亡,改善乙醇性大鼠胃溃疡

  我们通过UPLC ESI Orbitrap MS在正离子模式和负离子模式下分析LF中化学成分的特征(图1)。表2中列出了具有碱性类黄酮结构的主要成分。

  如图2B和C所示,与正常(NC)组相比,给予乙醇导致胃损伤,表现为多发性线性出血、局灶性糜烂和溃疡指数非常明显升高(p<0.0001)。然而,与GU组相比,我们在LF(150 mg/kg和300 mg/kg)或奥美拉唑(OME)给药中观察到黏膜出血条纹的长度和数量显著减少,表明LF对溃疡的改善。此外,LFH具有与阳性对照药物相当的胃保护潜力。

  H&E染色证实了LF减轻乙醇诱导的胃黏膜损伤的能力,而NC组显示出完整的胃黏膜结构和整齐排列的胃腺(图2D)。如箭头所示,乙醇诱导了一系列明显的损伤,其特征是局灶性坏死、黏膜出血性损伤、黏膜下水肿、炎症细胞浸润以及上皮细胞损失。然而,与GU组相比,OME、LF(150 mg/kg)和LF(300 mg/kg)组的黏膜损伤显著减轻。总之,研究根据结果得出LF改善了GU大鼠的组织病理学表现。

  接下来,我们评估了LF对抗氧化应激和抗炎症的影响。如图2E-H所示,与NC大鼠相比,乙醇诱导的大鼠MDA含量非常明显升高,而GSH、SOD和CAT活性显著下降。然而,OME和LF(150 mg/kg、300 mg/kg)处理将上述抗氧化因子逆转至正常水平。此外,OME、LFL和LFH均显著逆转了乙醇引起的NF-κb、TNF-α、IL-1β和IL-6水平的升高以及Iκbα水平的降低(图2I-M)。

  如图2N-M所示,与NC大鼠相反,GU大鼠血清和胃组织中的NO浓度显著降低(p  0.001)。同时,LF(150 mg/kg、300 mg/kg)能够以剂量依赖的方式显著恢复NO浓度。

  在这一部分中,我们基于液相色谱-质谱法(LC-MS)对NC、GU和LFH组的血清分析了非靶向代谢组学图谱。QC样品在正离子和负离子检测模式下的总离子色谱(基峰)如图3A和B所示,表明仪器是稳定的。经过峰校正和组内去除缺失值  50%的离子峰,我们分别以正离子和负离子模式去除了499和377种代谢物。PLS-DA在NC组、GU组和LFH组之间有明显的代谢物聚集(图3C和D)。我们得知GU组与NC组的距离最远,然而,LFH组有接近NC组的趋势,表明乙醇引发了代谢产物的变化,LF(300mg/kg)处理在内源性物质含量迁移到正常水平方面发挥了作用。

  图3 NC、GU和LFH组的QC样本检验和偏最小二乘判别分析(PLS-DA)。ESI+模型(A)和ESI-模型(B)中QC样品的基峰。ESI+模型(C)和ESI-模型(D)的PLS-DA分析(n=8)。

  NC组与GU组和GU与LFH组的OPLS-DA评分图显示出明显的分离(图4)。此外,我们还进行了200置换检验,以验证OPLS-DA模型的可靠性。根据结果得出,Q2回归线,表明根据实验数据建立的OPLS-DA模型没有过拟合,该模型在筛选差异代谢物方面具有较高的可靠性。

  根据OPLS-DA获得的VIP1.0和p值<0.05,共有165种代谢产物被定义为差异代谢产物。与NC组相比,GU组分别有49种和22种代谢产物被显著诱导和抑制。然而,LF部分逆转了乙醇诱导胃损伤的代谢变化,消除了GU大鼠的25种代谢变化,其中16种下调,9种上调。因此,这25种代谢产物被定义为LF保护作用的关键生物标志物。表S1中总结了这些生物标志物不同组中相应的化合物名称、质荷比(m/z)、分子式、保留时间和变化趋势。与LF处理相比,乙醇诱导改变的差异代谢产物通过热图可视化(图5A)。

  图5 LFH治疗GU大鼠的热图和潜在代谢组学途径。(A)与GU大鼠相比,LFH改变的差异代谢产物的热图。(B)LFH改变的生物标志物的通路分析。1:苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成;2:抗坏血酸和aldarate代谢;3:烟酸和烟酰胺代谢;4:酪氨酸代谢;5:戊糖和葡萄糖醛酸相互转化;6:卟啉和叶绿素代谢;7:色氨酸代谢;8:组氨酸代谢;9:精氨酸和脯氨酸代谢;10:缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解;11:谷胱甘肽代谢。(C)LFH处理GU大鼠的代谢网络。红色粗体的代谢物是GU大鼠与NC组相比的生物标志物。蓝色“↑”表示与GU组相比,代谢产物被LFH增加;红色“↓”表示与GU组相比,代谢产物被LFH降低。

  图6 结合代谢组学和网络药理学分析。(A)LF靶点和差异代谢物靶点之间的重叠。(B)“成分-靶点-代谢物”相互作用网络。橙色点表示LF的成分。三角形表示不同的代谢物。蓝点代表LF对抗GU的潜在靶点。(C)潜在靶点的PPI网络。(D)GO分析和(E)KEGG途径富集的潜在靶点。

  为了进一步研究LF改善胃溃疡的可能机制,我们在MetaboAnalyst5.0中引入了不同的代谢产物(用于途径富集。如表3和图5B所示,共富集了11条代谢途径。在途径影响0.1的条件下,五种代谢途径被认为是关键的代谢途径,包括氨基酸代谢、碳水化合物代谢以及辅因子和维生素的代谢。代谢物网络和相关途径如图5C所示。

  如图6A所示,我们在LF靶点和潜在代谢物相关靶点之间鉴定出176个重叠靶点。使用Cytoscape(版本3.10.0)软件,建立了一个“成分-靶点-代谢物”网络,以说明LF和差异代谢物之间的复杂关系(图6B)。根据节点degree,我们筛选出显著的活性成分。LF中更重要的成分是甘草素、甘草黄酮A、甘草查尔酮A、甘草查尔酮B和Echinatin,在degree上排名前五。这表明这些活性成分对正常代谢产物和胃保护至关重要。

  为了进一步探讨LF抗胃溃疡的潜在机制,我们建立了由176个节点和414条边组成的PPI网络(图6C)。如图所示,热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)(D = 33)、苏氨酸激酶1(AKT1)(D = 32)、有丝分裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)(D = 29)、表皮生长因子受体(EGFR)(D = 26)、雌激素受体1(ESR1)(D = 21)和磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶催化亚基α(PIK3CA)(D = 18)在PPI网络中占据核心地位,被认为是LF治疗胃溃疡的核心靶点。此外,生物过程(BP)、分子功能(MF)和细胞成分(CC)中按p值排序的前十个富集GO项如图6D所示,提示LF可能会影响炎症反应、细胞凋亡过程的负调控、质膜、胞质溶胶、锌离子结合和酶结合。基于KEGG富集分析(图6E),LF可能在调节PI3K-AKT信号通路、Rap1信号通路、HIF-1信号通路和MAPK信号通路中发挥重要作用。

  此外,我们还采用分子对接方法分析了LF的五种核心成分与六种核心靶点(HSP90AA1、AKT1、MAPK1、EGFR、ESR1、PIK3CA)之间的相互作用。更稳定的配体-受体配置需要更低的结合能,这反映在对接得分中。如前所述,小于-5.0 kcal/mol的对接得分表明配体和受体之间拥有非常良好的结合活性。如表S2所示,所有核心靶点,特别是AKT1和PIK3CA,对LF中的治疗成分拥有非常良好的结合亲和力(对接得分<−5.0 kcal/mol)。每个靶点的最佳对接结果进一步显示为3D和2D结合图(图7)。核心成分与关键靶点形成稳定的复合物,例如,甘草黄酮A与与AKT1结合的氨基酸残基GLN79和ASN54形成两个氢键。甘草黄酮A-PIK3CA复合物通过一个氢键稳定在氨基酸残基上。

  图7 三维和二维对接模型的关键靶点的最优对接结果。(A)甘草查尔酮A-HSP90AA1;(B)甘草黄酮A-AKT1;(C)甘草黄酮A-MAPK1;(D)甘草黄酮A-EGFR;(E)甘草查尔酮B-ESR1;(F)甘草黄酮 A-PIK3CA。

  我们使用RT-qPCR检测上述关键靶点,以探讨它们是否参与LF在GU中介导的作用。如图8所示,GU组HSP90AA1、AKT1、MAPK1、EGFR、ESR1和PIK3CA的表达均受到显著抑制,而在LF给药中观察到上述基因的显著增加,提示LF能调节这些核心基因的表达。

  新出现的证据说明,摄入乙醇可能会抑制PI3K-AKT信号通路,然而,PI3K-AKT的激活与促进葡萄糖代谢、参与细胞增殖和黏膜修复有关。如图9A-E所示,与NC组相比,GU组的p-PI3K、PI3K、p-AKT和AKT水平明显受到抑制(p  0.05),而与GU组相比,LF给药有效地增强了这些蛋白质的表达(p  0.05)。为了验证PI3K/AKT通路是否参与LF抑制细胞凋亡,我们检测了下游凋亡相关蛋白。我们得知,两种剂量的LF给药都可以逆转Bax和胱天蛋白酶-3的增加,以及乙醇灌胃诱导的Bcl-2下调(图9F-H)。

  然后,我们通过TUNEL染色观察胃黏膜细胞的凋亡变化。凋亡细胞在GU组中增加,而在LF处理组中减少(图9I)。研究结果有力地表明,LF能够最终靠激活PI3K/AKT通路抑制细胞凋亡来减轻GU。

  GU是一种多因素的胃肠道疾病,乙醇是引起胃溃疡的主要诱因之一。奥美拉唑等常用药物的临床治疗需求因其不良反应而受到限制。甘草是中医系统中最突出的材料之一,传统上用于多种调节消化系统的制剂,甘草黄酮类化合物大多数都用在治疗胃和十二指肠溃疡。此外,甘草作为最常用的“药食同源”草药之一,可以为GU治疗提供高效低毒的疗效。鉴于目前尚不清楚LF的作用机制以及LF抗溃疡是否与调节代谢有关,因此我们采用基于UPLC-Q-TOF/MS的代谢组学和网络药理学相结合的方法来研究LF治疗GU的潜在基因和潜在机制。根据血清代谢组学分析,LF可以部分逆转乙醇诱导的胃损伤中涉及的代谢途径,尤其是参与葡萄糖利用的氨基酸代谢。此外,代谢组学结合网络药理学表明,PI3K-AKT信号通路是LF改善GU的潜在途径之一。更重要的是,LF通过激活PI3K/AKT通路来减弱胃细胞凋亡,这与预测的结果一致。

  由于乙醇诱导的GU发病机制与人类非常相似,因此我们在研究中使用该模型来评估LF的胃保护作用。在给予高浓度乙醇后,GU组的黏膜受到显著损伤,出现多条不规则出血带,溃疡指数非常明显升高。从宏观和微观观察来看,LF能促进胃修复,减少病理损伤,说明LF对胃溃疡有一定的治疗作用。先前的研究已经证实,氧化应激和炎症反应是酒精诱导的胃黏膜损伤的必然特征。氧化应激的代谢产物MDA表明自由基激活的脂质过氧化介导细胞损伤。此外,GSH、SOD和CAT被认为是保护性介质,可以清除自由基,抑制脂质过氧化,保护细胞免受损伤。更重要的是,过度的氧化应激会诱导IκBα的泛素化和降解,以及随后的NF-κB活化,使其自由易位进入细胞核;接下来,它促进以促炎细胞因子水平为代表的侵袭性因子的产生,如TNF-a、IL-6和IL-1β。先前的研究表明,LF在各种疾病中具有抗氧化和抗炎能力,我们的研究结果还表明,LF逆转了乙醇摄入后胃中MDA含量增加、GSH含量降低、SOD和CAT活性降低的现象。此外,LF下调NF-κB、TNF-α、IL-1、IL-6的mRNA水平,上调IκBα,从而对GU发挥抗炎作用。

  NO作为一种内源性血管舒张物质,通过血管舒张和促进血液流动,在维持黏膜完整性和黏膜防御方面发挥着直接作用。此外,已经证明NO对大鼠胃肠黏膜细胞具有抗凋亡作用。与之前的研究一致,我们的研究根据结果得出,LF显著改善并将NO水平保持在正常范围内,表明其对黏膜完整性有有益影响。

  随后,我们研究了LF在GU治疗中的代谢组学。最终,我们初步鉴定出25种不同的代谢产物,包括酪氨酸、烟酰胺、亚精胺、丝氨酸、3-羟基邻氨基苯甲酸酯,它们参与11种代谢途径。其中,苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的生物合成(影响 = 0.5)、抗坏血酸和aldarate代谢(影响 = 0.25),烟酸和烟酰胺代谢(影响 = 0.194),酪氨酸代谢(影响 = 0.139),以及戊糖和葡萄糖醛酸相互转化(影响 = 0.125)是很重要的。

  先前的研究强调了氨基酸代谢紊乱对异常生理功能的影响及其在GU发展中的作用。苯丙氨酸羟化酶催化苯丙氨酸转化为L-酪氨酸,L-酪氨酸进一步转化为多巴胺。多巴胺是胃的保护因子,对胃肠运动、胃黏膜血流量和胃酸分泌具有调节作用。大量证据支持通过调节多巴胺能改善胃溃疡。L-色氨酸是蛋白质合成的必需氨基酸,参与炎症、氧化应激和免疫的调节,其代谢紊乱可能会引起神经系统功能障碍,进而影响胃肠系统的功能。此外,色氨酸通过犬尿氨酸途径的代谢过程导致烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)的从头合成,影响烟酰胺代谢途径。3-羟基邻氨基苯甲酸是色氨酸的下游代谢产物,是L-色氨酸转化为烟酰胺的限制因素。在本研究中,GU组的酪氨酸、色氨酸和3-羟基邻氨基苯甲酸水平发生了显著变化,而LF使代谢产物正常化,表明LF可能通过恢复氨基酸代谢破坏在胃黏膜中发挥保护作用。

  烟酰胺参与体内糖酵解、脂肪酸合成、三羧酸循环和组织呼吸的氧化过程。研究表明,烟酰胺具有胃保护作用,可能通过增强胃微血管通透性及其抗氧化特性发挥作用。NAD+由烟酰胺合成,是一种关键的细胞内氧化还原辅因子,也是多种代谢酶的底物。NAD+的失调与多种疾病的发生紧密关联。目前的研究表明,与NC组相比,GU组的烟酰胺异常减少,表明该生物体的氧化还原能力在GU大鼠中受到抑制。然而,LF恢复了烟酰胺的水平,提高抗氧化能力,从而修复胃黏膜。

  结合代谢组学和网络药理学策略,我们进一步探讨了LF治疗GU的机制。通过构建“成分-靶点-代谢产物”网络,发现了6个关键靶点(HSP90AA1、AKT1、MAPK1、EGFR、ESR1、PIK3CA),它们都与GU的发病机制紧密关联。此外,KEGG分析表明,PI3K/AKT信号通路可能在LF减轻胃溃疡中发挥重要作用。

  一方面,葡萄糖代谢是维持能量来源的重要方法,尤其是在胃溃疡修复过程中,它高度依赖于葡萄糖的利用。活化的AKT增强葡萄糖的转运,PI3K/AKT信号激活诱导葡萄糖激酶表达增加并促进葡萄糖代谢。LF调节的烟酸和烟酰胺代谢以及苯丙氨酸代谢也参与糖酵解途径,促进能量代谢,提示LF能够最终靠PI3K/AKT途径调节代谢,促进胃黏膜修复。

  另一方面,研究证明这些关键靶点与PI3K/AKT信号通路以及胃肠道疾病有关。众所周知,EGFR对促进伤口愈合、促进黏膜和腺体再生至关重要,其激活可抑制胃黏膜细胞的凋亡,从而显著加速GU的修复。MAPK1是由PI3K诱导的EGFR的下游,与上皮增殖和黏膜修复增强有关。基于我们之前的研究,已经证实LF能够最终靠激活EGFR/ERK途径促进上皮细胞的增殖和胃黏膜的修复来减轻GU。ESR1编码雌激素受体ERα和配体激活的转录因子。类黄酮与雌激素结构相似,被称为植物雌激素,通过雌激素受体ERα和ERβ发挥抗氧化机制和抗炎作用,缓解胃溃疡。此外,当ERα与雌激素结合时,它会导致MAPK1/2、PI3K和AKT的激活。PIK3CA和AKT1被认为是PI3K/AKT信号通路中的关键节点,在调节细胞存活、增殖、迁移和凋亡中发挥着至关重要的作用。

  过度的细胞凋亡会破坏黏膜的完整性,最后导致黏膜损伤。凋亡抑制蛋白Bcl-2控制线粒体膜通透性,通过阻止细胞色素C释放到细胞质中来抑制细胞凋亡。Bax是促凋亡的代表,具有与Bcl-2相反的功能,刺激凋亡小泡的形成,并最终激活凋亡执行子Caspase-3,导致细胞凋亡。我们的研究表明,在乙醇诱导的GU大鼠胃组织中,促凋亡的Bax和胱天蛋白酶-3明显地增加,Bcl-2受到抑制,但LF激活了PI3K/AKT通路,随后下调了Bax、胱天蛋白酶3的蛋白表达,并上调了Bcl-2。此外,TUNEL染色也证实了LF可以有效的预防乙醇诱导的胃黏膜细胞凋亡。上述证据说明,LF可能通过PI3K/AKT信号通路预防细胞凋亡损伤并维持胃黏膜完整性。

  总之,LF通过减少氧化应激和炎症、调节代谢、抑制胃黏膜细胞凋亡,对GU发挥胃保护作用。更重要的是,LF通过抑制细胞凋亡和通过激活PI3K/AKT途径维持胃黏膜完整性来改善乙醇诱导的GU。本研究对探讨LF的抗胃溃疡作用及其机制具备极其重大意义,提示其具有成为胃黏膜保护剂的潜力。

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